序列準(zhǔn)確性:
反義寡核苷酸的序列必須與目標(biāo)mRNA或DNA序列完全匹配或具有特定的互補性。任何序列錯誤都可能導(dǎo)致其失去與靶標(biāo)結(jié)合的能力或產(chǎn)生非特異性結(jié)合。
在合成前,應(yīng)仔細(xì)檢查和驗證寡核苷酸的序列,確保與預(yù)期的靶標(biāo)序列一致。
純度:
反義寡核苷酸的純度對其功能至關(guān)重要。合成過程中可能產(chǎn)生的雜質(zhì),如缺失、插入、錯配或未完全去除的副產(chǎn)物,都可能影響其穩(wěn)定性和特異性。
應(yīng)使用高效的純化方法,如高效液相色譜(HPLC)或凝膠電泳,來去除這些雜質(zhì)。
修飾:
反義寡核苷酸可能需要進行化學(xué)修飾以提高其穩(wěn)定性、親和力或降低其免疫原性。
在合成過程中,應(yīng)確保修飾步驟的正確性和效率,以及修飾后寡核苷酸的純度和穩(wěn)定性。
硫代修飾:
硫代修飾(Phosphorothioate modifications)常用于提高反義寡核苷酸的穩(wěn)定性和抗核酸酶降解能力。
在進行硫代修飾時,應(yīng)確保修飾的均勻性和一致性,以避免對寡核苷酸的結(jié)合能力產(chǎn)生負(fù)面影響。
質(zhì)量控制:
在合成過程中,應(yīng)進行嚴(yán)格的質(zhì)量控制,包括序列驗證、純度分析、修飾效率檢測等。
還應(yīng)確保合成批次之間的一致性,以及不同批次之間的可比較性。